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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG0390 | ACDHYP-![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | DNA repair protein, SNF2 family |
HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
8240 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Homo sapiens (Hsa) | RAD54B | GI:6912622 | Q9UF71 |
Pan troglodytes (Ptr) | RAD54B | GI:114620949 | |
Canis familiaris (Cfa) | RAD54B | GI:73999360 | |
Mus musculus (Mmu) | E130016E03Rik | GI:88319960 | |
Rattus norvegicus (Rno) | RGD1306507 | GI:109474671 | |
Gallus gallus (Gga) | RAD54B | GI:45382655 | |
Anopheles gambiae (Aga) | AgaP_AGAP006945 | GI:158286564 | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | rdh54 (SPAC22F3.03c) | GI:63054489 | Q09772 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | RDH54 (S000000277) | GI:37362617 | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0F11814g | GI:50311185 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_AGL212W | GI:45200885 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||
GO:0003678 | DNA helicase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0003724 | RNA helicase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0004003 | ATP-dependent DNA helicase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0015616 | DNA translocase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000727 | double-strand break repair via break-induced replication | P |
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GO:0006200 | ATP catabolic process | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006312 | mitotic recombination | P |
| ||||||||||||||||
GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
| ||||||||||||||||
GO:0030491 | heteroduplex formation | P |
| ||||||||||||||||
GO:0032392 | DNA geometric change | P |
| ||||||||||||||||
GO:0045144 | meiotic sister chromatid segregation | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_820 | ![]() |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Anopheles gambiae (Aga) | aga2402 | ENSANGP00000007696 | |
Anopheles gambiae (Aga) | aga10783 | ENSANGP00000026244 | |
Ashbya gossypii (Ago) | ago2208 | AEL297W | |
Ashbya gossypii (Ago) | ago4100 | AGL212W | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath14198 | At3g19210.1 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel17139 | W06D4.6 (CE25143; WBGene00004298) | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl2703 | CAGL0I04224g | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl4740 | CAGL0M01958g | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne853 | 163.m06197 | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne5814 | 179.m00689 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi5483 | DDB0185308 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi9169 | DDB0186351 | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha2574 | DEHA0D06248g | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha4699 | DEHA0F07106g | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme512 | CG3736-PA (FBgn0002989) | |
Danio rerio (Dre) | dre23033 | ENSDARP00000007237 | |
Danio rerio (Dre) | dre7161 | ENSDARP00000029529 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru21626 | SINFRUP00000158835 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru6997 | SINFRUP00000161058 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru6998 | SINFRUP00000174468 | |
Gallus gallus (Gga) | gga22726 | ENSGALP00000016844 (RAD54L) | O12944 |
Gallus gallus (Gga) | gga11351 | ENSGALP00000025665 (RAD54B) | Q9DG67 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa1087 | ENSP00000262745 | |
Homo sapiens (Hsa) | hsa30529 | ENSP00000336606 (RAD54B) | Q9Y620 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla131 | KLLA0A03069g | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla4616 | KLLA0F11814g | |
Mus musculus (Mmu) | mmu17827 | ENSMUSP00000039366 | |
Mus musculus (Mmu) | mmu17825 | ENSMUSP00000066977 (MGI:3605986) | Q6PFE3 |
Mus musculus (Mmu) | mmu18679 | ENSMUSP00000067025 | |
Mus musculus (Mmu) | mmu18677 | ENSMUSP00000071140 | |
Mus musculus (Mmu) | mmu18678 | ENSMUSP00000072447 | |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr9815 | NCU10090.2 | |
Oryza sativa (Osa) | osa29613 | 4331.m00204 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa1900 | PF08_0126 | |
Rattus norvegicus (Rno) | rno23692 | ENSRNOP00000018004 (RGD:1310600) | B5DFE8 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce329 | YBR073W (S000000277) | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce2258 | YGL163C (S000003131) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo264 | SPAC15A10.03c | P41410 |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo1845 | SPAC22F3.03c | Q09772 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli1042 | YALI0B07513g | |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli4874 | YALI0E24431g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005819 | spindle | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0003684 | damaged DNA binding | F |
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GO:0004003 | ATP-dependent DNA helicase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0004386 | helicase activity | F |
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GO:0005524 | ATP binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0015616 | DNA translocase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0033170 | protein-DNA loading ATPase activity | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000722 | telomere maintenance via recombination | P |
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GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | P |
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GO:0000727 | double-strand break repair via break-induced replication | P |
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GO:0006200 | ATP catabolic process | P |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006302 | double-strand break repair | P |
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GO:0006310 | DNA recombination | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006311 | meiotic gene conversion | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006417 | regulation of translation | P |
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GO:0006915 | apoptosis | P |
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GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
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GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008298 | intracellular mRNA localization | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010212 | response to ionizing radiation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010332 | response to gamma radiation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030261 | chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030491 | heteroduplex formation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0032079 | positive regulation of endodeoxyribonuclease activity | P |
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GO:0032392 | DNA geometric change | P |
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GO:0033554 | cellular response to stress | P |
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GO:0042493 | response to drug | P |
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GO:0045003 | double-strand break repair via synthesis-dependent strand annealing | P |
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GO:0045144 | meiotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0046843 | dorsal appendage formation | P |
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GO:0048477 | oogenesis | P |
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GO:0051321 | meiotic cell cycle | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPAC22F3.03c (Q09772) | YBR073W (S000000277) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0004003 | ATP-dependent DNA helicase activity | F |
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GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
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GO:0015616 | DNA translocase activity | F |
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GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | P |
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GO:0000727 | double-strand break repair via break-induced replication | P |
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GO:0006200 | ATP catabolic process | P |
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GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
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GO:0030491 | heteroduplex formation | P |
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GO:0032392 | DNA geometric change | P |
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GO:0045144 | meiotic sister chromatid segregation | P |
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