YOGY Home | YOGY Help |
|
KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG1756 | AC-HYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | Histone 2A |
HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
115922 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Homo sapiens (Hsa) | H2AFX | GI:4504253 | P16104 |
Pan troglodytes (Ptr) | H2AFJ | GI:114643719 | |
Canis familiaris (Cfa) | LOC489372 | GI:73955042 | |
Mus musculus (Mmu) | H2afx (MGI:102688) | GI:7106331 | P27661 |
Rattus norvegicus (Rno) | H2afx (RGD:735124) | GI:109483394 | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | hta2 (SPAC19G12.06c) | GI:19115333 | P04910 |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | hta1 (SPCC622.08c) | GI:19075680 | P04909 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | HTA2 (S000000099) | GI:6319470 | P04912 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | HTA1 (S000002633) | GI:6320431 | P04911 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0E17413g | GI:50309449 | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0F13332g | GI:50311311 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_AGR184W | GI:45201280 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_AEL003C | GI:45190604 | |
Magnaporthe grisea (Mgr) | MGG_03577 | GI:39942994 | |
Neurospora crassa (Ncr) | NCU02437.1 | GI:32421539 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | GAMMA-H2AX | GI:15221875 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | H2AXA | GI:15223948 | |
Oryza sativa (Osa) | Os03g0721900 | GI:115455011 | |
Oryza sativa (Osa) | Os12g0530000 | GI:115488866 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
GO:0000781 | chromosome, telomeric region | C |
| ||||||||||||||
GO:0000785 | chromatin | C |
| ||||||||||||||
GO:0000786 | nucleosome | C |
| ||||||||||||||
GO:0000788 | nuclear nucleosome | C |
| ||||||||||||||
GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
| ||||||||||||||
GO:0001673 | male germ cell nucleus | C |
| ||||||||||||||
GO:0001741 | XY body | C |
| ||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||
GO:0005654 | nucleoplasm | C |
| ||||||||||||||
GO:0005657 | replication fork | C |
| ||||||||||||||
GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||
GO:0031298 | replication fork protection complex | C |
| ||||||||||||||
GO:0044451 | nucleoplasm part | C |
| ||||||||||||||
GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0003684 | damaged DNA binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0019899 | enzyme binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0042393 | histone binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0000077 | DNA damage checkpoint | P |
| ||||||||||||||
GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | P |
| ||||||||||||||
GO:0006281 | DNA repair | P |
| ||||||||||||||
GO:0006302 | double-strand break repair | P |
| ||||||||||||||
GO:0006323 | DNA packaging | P |
| ||||||||||||||
GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||||
GO:0006334 | nucleosome assembly | P |
| ||||||||||||||
GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
| ||||||||||||||
GO:0006975 | DNA damage induced protein phosphorylation | P |
| ||||||||||||||
GO:0007283 | spermatogenesis | P |
| ||||||||||||||
GO:0007569 | cell aging | P |
| ||||||||||||||
GO:0010212 | response to ionizing radiation | P |
| ||||||||||||||
GO:0042770 | DNA damage response, signal transduction | P |
| ||||||||||||||
GO:0045739 | positive regulation of DNA repair | P |
| ||||||||||||||
GO:0045816 | negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter, global | P |
| ||||||||||||||
GO:0065007 | biological regulation | P |
|