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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG1724 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
CELLULAR PROCESSES AND SIGNALING | SCF ubiquitin ligase, Skp1 component |
HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
38775 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Homo sapiens (Hsa) | SKP1 | GI:25777713 | |
Pan troglodytes (Ptr) | SKP1 | GI:114601681 | |
Canis familiaris (Cfa) | SKP1 | GI:73971203 | |
Drosophila melanogaster (Dme) | skpB (FBgn0026176) | GI:19922070 | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | psh1 | GI:19112247 | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | SKP1 (S000002736) | GI:6320535 | P52286 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0E16995g | GI:50309411 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_ADR295C | GI:45188169 | |
Magnaporthe grisea (Mgr) | MGG_04978 | GI:39940524 | |
Neurospora crassa (Ncr) | NCU08991.1 | GI:32421879 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0000776 | kinetochore | C |
| ||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||
GO:0005654 | nucleoplasm | C |
| ||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||
GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | C |
| ||||||||||||
GO:0031518 | CBF3 complex | C |
| ||||||||||||
GO:0043291 | RAVE complex | C |
| ||||||||||||
GO:0003688 | DNA replication origin binding | F |
| ||||||||||||
GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F |
| ||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||
GO:0000082 | G1/S transition of mitotic cell cycle | P |
| ||||||||||||
GO:0000086 | G2/M transition of mitotic cell cycle | P |
| ||||||||||||
GO:0000910 | cytokinesis | P |
| ||||||||||||
GO:0000921 | septin ring assembly | P |
| ||||||||||||
GO:0006461 | protein complex assembly | P |
| ||||||||||||
GO:0006508 | proteolysis | P |
| ||||||||||||
GO:0007035 | vacuolar acidification | P |
| ||||||||||||
GO:0007096 | regulation of exit from mitosis | P |
| ||||||||||||
GO:0016567 | protein ubiquitination | P |
| ||||||||||||
GO:0031146 | SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
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GO:0042787 | protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
| ||||||||||||
GO:0043254 | regulation of protein complex assembly | P |
| ||||||||||||
GO:0045116 | protein neddylation | P |
| ||||||||||||
GO:0051382 | kinetochore assembly | P |
| ||||||||||||
GO:0051437 | positive regulation of ubiquitin-protein ligase activity involved in mitotic cell cycle | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_821 | ![]() |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Anopheles gambiae (Aga) | aga10753 | ENSANGP00000011120 | |
Ashbya gossypii (Ago) | ago2037 | ADR295C | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath6911 | At1g75950.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath26012 | At5g42190.1 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel9307 | F46A9.4 (CE10578; WBGene00004808) | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel9308 | F46A9.5 (CE10580; WBGene00004807) | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl4714 | CAGL0M01364g | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne2507 | 181.m08551 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi11766 | DDB0185043 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi11510 | DDB0191107 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi1457 | DDB0217221 | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha5618 | DEHA0F27555g | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15941 | CG16983-PA (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15944 | CG16983-PB (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15945 | CG16983-PC (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15942 | CG16983-PD (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15947 | CG16983-PE (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15946 | CG16983-PF (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15943 | CG16983-PG (FBgn0025637) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme4600 | CG8881-PA (FBgn0026176) | |
Danio rerio (Dre) | dre26023 | ENSDARP00000015887 (skp1a) | Q6PBY8 |
Takifugu rubripes (Fru) | fru12959 | SINFRUP00000156654 | |
Gallus gallus (Gga) | gga6023 | ENSGALP00000010447 (SKP1) | Q5ZKF5 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa25728 | ENSP00000231487 (SKP1) | P63208-1 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa25729 | ENSP00000331708 (SKP1) | P63208-2 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla3712 | KLLA0E16995g | |
Mus musculus (Mmu) | mmu3623 | ENSMUSP00000038744 (MGI:103575) | Q9WTX5 |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr8762 | NCU08991.2 | |
Oryza sativa (Osa) | osa4716 | 2337.m00120 | |
Oryza sativa (Osa) | osa4719 | 2337.m00123 | |
Oryza sativa (Osa) | osa47989 | 5654.m00164 | |
Oryza sativa (Osa) | osa47998 | 5654.m00170 | |
Oryza sativa (Osa) | osa53511 | 6134.m00171 | |
Oryza sativa (Osa) | osa53519 | 6134.m00177 | |
Oryza sativa (Osa) | osa56819 | 6202.m00137 | |
Oryza sativa (Osa) | osa56824 | 6202.m00140 | |
Oryza sativa (Osa) | osa58244 | 6460.m00120 | |
Oryza sativa (Osa) | osa61273 | 6588.m00201 | |
Oryza sativa (Osa) | osa62911 | 6609.m00209 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa4107 | MAL13P1.337 | |
Rattus norvegicus (Rno) | rno4949 | ENSRNOP00000007676 (RGD:1359648) | Q6PEC4 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce1386 | YDR328C (S000002736) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo2463 | SPBC409.05 | Q9Y709 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli368 | YALI0A10879g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||
GO:0000151 | ubiquitin ligase complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000776 | kinetochore | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005813 | centrosome | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005819 | spindle | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005875 | microtubule associated complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0009524 | phragmoplast | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0031518 | CBF3 complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0043291 | RAVE complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0003688 | DNA replication origin binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000082 | G1/S transition of mitotic cell cycle | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000086 | G2/M transition of mitotic cell cycle | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000132 | establishment of mitotic spindle orientation | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000239 | pachytene | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000910 | cytokinesis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000920 | cytokinetic cell separation | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000921 | septin ring assembly | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0002009 | morphogenesis of an epithelium | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006461 | protein complex assembly | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006508 | proteolysis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006998 | nuclear envelope organization | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007035 | vacuolar acidification | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007067 | mitosis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007095 | mitotic cell cycle G2/M transition DNA damage checkpoint | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007096 | regulation of exit from mitosis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007126 | meiosis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007140 | male meiosis | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007346 | regulation of mitotic cell cycle | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0008285 | negative regulation of cell proliferation | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
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GO:0008406 | gonad development | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0010824 | regulation of centrosome duplication | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0016246 | RNA interference | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0016567 | protein ubiquitination | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0018991 | oviposition | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0030261 | chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0031146 | SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0040010 | positive regulation of growth rate | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0040035 | hermaphrodite genitalia development | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042023 | DNA endoreduplication | P |
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GO:0042493 | response to drug | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042787 | protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0043254 | regulation of protein complex assembly | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0045116 | protein neddylation | P |
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GO:0045132 | meiotic chromosome segregation | P |
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GO:0045841 | negative regulation of mitotic metaphase/anaphase transition | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0045910 | negative regulation of DNA recombination | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0045931 | positive regulation of mitotic cell cycle | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0051298 | centrosome duplication | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0051382 | kinetochore assembly | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0070072 | vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPBC409.05 (Q9Y709) | YDR328C (S000002736) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0000776 | kinetochore | C |
| ||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | C |
| ||||||||||||
GO:0031518 | CBF3 complex | C |
| ||||||||||||
GO:0043291 | RAVE complex | C |
| ||||||||||||
GO:0003688 | DNA replication origin binding | F |
| ||||||||||||
GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F |
| ||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||
GO:0000082 | G1/S transition of mitotic cell cycle | P |
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GO:0000086 | G2/M transition of mitotic cell cycle | P |
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GO:0000910 | cytokinesis | P |
| ||||||||||||
GO:0000920 | cytokinetic cell separation | P |
| ||||||||||||
GO:0000921 | septin ring assembly | P |
| ||||||||||||
GO:0006461 | protein complex assembly | P |
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GO:0006508 | proteolysis | P |
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GO:0006998 | nuclear envelope organization | P |
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GO:0007035 | vacuolar acidification | P |
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GO:0007095 | mitotic cell cycle G2/M transition DNA damage checkpoint | P |
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GO:0007096 | regulation of exit from mitosis | P |
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GO:0007346 | regulation of mitotic cell cycle | P |
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GO:0031146 | SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
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GO:0042493 | response to drug | P |
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GO:0042787 | protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
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GO:0043254 | regulation of protein complex assembly | P |
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GO:0045116 | protein neddylation | P |
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GO:0045841 | negative regulation of mitotic metaphase/anaphase transition | P |
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GO:0051382 | kinetochore assembly | P |
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GO:0070072 | vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly | P |
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