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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG0264 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | Nucleosome remodeling factor, subunit CAF1/NURF55/MSI1 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||
GO:0000123 | histone acetyltransferase complex | C |
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GO:0000778 | condensed nuclear chromosome kinetochore | C |
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GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005667 | transcription factor complex | C |
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GO:0005677 | chromatin silencing complex | C |
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GO:0005678 | chromatin assembly complex | C |
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GO:0005700 | polytene chromosome | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0009507 | chloroplast | C |
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GO:0016580 | Sin3 complex | C |
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GO:0016581 | NuRD complex | C |
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GO:0016585 | chromatin remodeling complex | C |
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GO:0016589 | NURF complex | C |
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GO:0031511 | Mis6-Sim4 complex | C |
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GO:0031523 | Myb complex | C |
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GO:0032221 | Rpd3S complex | C |
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GO:0033186 | CAF-1 complex | C |
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GO:0033698 | Rpd3L complex | C |
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GO:0035098 | ESC/E(Z) complex | C |
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GO:0043596 | nuclear replication fork | C |
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GO:0070210 | Rpd3L-Expanded complex | C |
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GO:0080008 | CUL4 RING ubiquitin ligase complex | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0003682 | chromatin binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
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GO:0030528 | transcription regulator activity | F |
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GO:0035035 | histone acetyltransferase binding | F |
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GO:0042054 | histone methyltransferase activity | F |
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GO:0042393 | histone binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042826 | histone deacetylase binding | F |
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GO:0046872 | metal ion binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0046974 | histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) | F |
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GO:0046976 | histone methyltransferase activity (H3-K27 specific) | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0000122 | negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0000910 | cytokinesis | P |
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GO:0001703 | gastrulation with mouth forming first | P |
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GO:0001708 | cell fate specification | P |
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GO:0002119 | nematode larval development | P |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006334 | nucleosome assembly | P |
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GO:0006335 | DNA replication-dependent nucleosome assembly | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006349 | regulation of gene expression by genetic imprinting | P |
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GO:0006350 | transcription | P |
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GO:0007059 | chromosome segregation | P |
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GO:0007265 | Ras protein signal transduction | P |
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GO:0007275 | multicellular organismal development | P |
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GO:0007307 | eggshell chorion gene amplification | P |
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GO:0007346 | regulation of mitotic cell cycle | P |
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GO:0007369 | gastrulation | P |
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GO:0007517 | muscle organ development | P |
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GO:0008150 | biological_process | P |
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GO:0008283 | cell proliferation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008285 | negative regulation of cell proliferation | P |
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GO:0009555 | pollen development | P |
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GO:0009790 | embryo development | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
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GO:0009826 | unidimensional cell growth | P |
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GO:0009908 | flower development | P |
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GO:0009909 | regulation of flower development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009965 | leaf morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010026 | trichome differentiation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010090 | trichome morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010214 | seed coat development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016246 | RNA interference | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016568 | chromatin modification | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016571 | histone methylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016573 | histone acetylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016575 | histone deacetylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016584 | nucleosome positioning | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030261 | chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030308 | negative regulation of cell growth | P |
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GO:0031055 | chromatin remodeling at centromere | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0031066 | regulation of histone deacetylation at centromere | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0031507 | heterochromatin formation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0034080 | CenH3-containing nucleosome assembly at centromere | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0034613 | cellular protein localization | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0035067 | negative regulation of histone acetylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0040027 | negative regulation of vulval development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0040035 | hermaphrodite genitalia development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042766 | nucleosome mobilization | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0045138 | tail tip morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0045787 | positive regulation of cell cycle | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0048316 | seed development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0048366 | leaf development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0048557 | embryonic digestive tract morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0048666 | neuron development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0048813 | dendrite morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0051382 | kinetochore assembly | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0051574 | positive regulation of histone H3-K9 methylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0070317 | negative regulation of G0 to G1 transition | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0070370 | cellular heat acclimation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0070829 | heterochromatin maintenance | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0090053 | positive regulation of chromatin silencing at centromere | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0090055 | positive regulation of chromatin silencing at silent mating-type cassette | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
68672 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0000123 | histone acetyltransferase complex | C |
| ||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||
GO:0080008 | CUL4 RING ubiquitin ligase complex | C |
| ||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||
GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||
GO:0042393 | histone binding | F |
| ||||||||||||
GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||
GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
| ||||||||||||
GO:0008150 | biological_process | P |
| ||||||||||||
GO:0016573 | histone acetylation | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_371 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||
GO:0000123 | histone acetyltransferase complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000778 | condensed nuclear chromosome kinetochore | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005667 | transcription factor complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005678 | chromatin assembly complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005700 | polytene chromosome | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0016581 | NuRD complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0016585 | chromatin remodeling complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0016589 | NURF complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0031511 | Mis6-Sim4 complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0031523 | Myb complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0032221 | Rpd3S complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0033698 | Rpd3L complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0035098 | ESC/E(Z) complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0070210 | Rpd3L-Expanded complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0080008 | CUL4 RING ubiquitin ligase complex | C |
| ||||||||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0003682 | chromatin binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0016564 | transcription repressor activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0035035 | histone acetyltransferase binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042054 | histone methyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042393 | histone binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042826 | histone deacetylase binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0046974 | histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0046976 | histone methyltransferase activity (H3-K27 specific) | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0051082 | unfolded protein binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0000122 | negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0000910 | cytokinesis | P |
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GO:0001703 | gastrulation with mouth forming first | P |
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GO:0001708 | cell fate specification | P |
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GO:0002119 | nematode larval development | P |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
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GO:0006334 | nucleosome assembly | P |
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GO:0006335 | DNA replication-dependent nucleosome assembly | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
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GO:0006349 | regulation of gene expression by genetic imprinting | P |
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GO:0006350 | transcription | P |
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GO:0007059 | chromosome segregation | P |
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GO:0007275 | multicellular organismal development | P |
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GO:0007307 | eggshell chorion gene amplification | P |
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GO:0007346 | regulation of mitotic cell cycle | P |
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GO:0007369 | gastrulation | P |
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GO:0007517 | muscle organ development | P |
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GO:0008150 | biological_process | P |
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GO:0008283 | cell proliferation | P |
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GO:0009555 | pollen development | P |
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GO:0009790 | embryo development | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
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GO:0009909 | regulation of flower development | P |
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GO:0010026 | trichome differentiation | P |
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GO:0010214 | seed coat development | P |
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GO:0016246 | RNA interference | P |
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GO:0016568 | chromatin modification | P |
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GO:0016571 | histone methylation | P |
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GO:0016573 | histone acetylation | P |
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GO:0016575 | histone deacetylation | P |
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GO:0016584 | nucleosome positioning | P |
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GO:0030261 | chromosome condensation | P |
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GO:0031055 | chromatin remodeling at centromere | P |
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GO:0031066 | regulation of histone deacetylation at centromere | P |
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GO:0031507 | heterochromatin formation | P |
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GO:0034080 | CenH3-containing nucleosome assembly at centromere | P |
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GO:0034613 | cellular protein localization | P |
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GO:0040011 | locomotion | P |
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GO:0040027 | negative regulation of vulval development | P |
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GO:0040035 | hermaphrodite genitalia development | P |
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GO:0042766 | nucleosome mobilization | P |
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GO:0045138 | tail tip morphogenesis | P |
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GO:0045787 | positive regulation of cell cycle | P |
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GO:0048316 | seed development | P |
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GO:0048366 | leaf development | P |
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GO:0048557 | embryonic digestive tract morphogenesis | P |
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GO:0048666 | neuron development | P |
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GO:0048813 | dendrite morphogenesis | P |
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GO:0051382 | kinetochore assembly | P |
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GO:0070317 | negative regulation of G0 to G1 transition | P |
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GO:0070370 | cellular heat acclimation | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPAC29A4.18 (O14021) | YEL056W (S000000782) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0000123 | histone acetyltransferase complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0032221 | Rpd3S complex | C |
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GO:0033698 | Rpd3L complex | C |
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GO:0070210 | Rpd3L-Expanded complex | C |
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GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0042393 | histone binding | F |
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GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
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GO:0016573 | histone acetylation | P |
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GO:0016575 | histone deacetylation | P |
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GO:0030261 | chromosome condensation | P |
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