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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG1375 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
CELLULAR PROCESSES AND SIGNALING | Beta tubulin |
HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
68504 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Homo sapiens (Hsa) | TUBB2C | GI:5174735 | Q96HX0 |
Pan troglodytes (Ptr) | TUBB2C | GI:114627724 | |
Canis familiaris (Cfa) | TUBB2C | GI:73967439 | |
Mus musculus (Mmu) | Tubb2c (MGI:1915472) | GI:22165384 | P68372 |
Rattus norvegicus (Rno) | Tubb2c (RGD:735101) | GI:40018568 | |
Gallus gallus (Gga) | TUBB2C | GI:118099195 | |
Drosophila melanogaster (Dme) | betaTub56D | GI:24655737 | |
Anopheles gambiae (Aga) | AgaP_AGAP010929 | GI:158287872 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | tbb-4 (CE00850; WBGene00006538) | GI:17549915 | P41937 |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | alp12 | GI:19113442 | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | TUB2 (S000001857) | GI:14318481 | P02557 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0D05269g | GI:50306643 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_ACR225C | GI:45185911 | |
Magnaporthe grisea (Mgr) | MGG_00604 | GI:39974499 | |
Neurospora crassa (Ncr) | NCU04054.1 | GI:32405520 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | TUB5 | GI:18394812 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | TUB1 | GI:15222873 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
GO:0005618 | cell wall | C |
| ||||||||||||||
GO:0005773 | vacuole | C |
| ||||||||||||||
GO:0005816 | spindle pole body | C |
| ||||||||||||||
GO:0005827 | polar microtubule | C |
| ||||||||||||||
GO:0005828 | kinetochore microtubule | C |
| ||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||
GO:0005856 | cytoskeleton | C |
| ||||||||||||||
GO:0005874 | microtubule | C |
| ||||||||||||||
GO:0005880 | nuclear microtubule | C |
| ||||||||||||||
GO:0005881 | cytoplasmic microtubule | C |
| ||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||
GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||
GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||
GO:0045298 | tubulin complex | C |
| ||||||||||||||
GO:0005198 | structural molecule activity | F |
| ||||||||||||||
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton | F |
| ||||||||||||||
GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0042288 | MHC class I protein binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0051082 | unfolded protein binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
| ||||||||||||||
GO:0000743 | nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion | P |
| ||||||||||||||
GO:0006928 | cellular component movement | P |
| ||||||||||||||
GO:0007017 | microtubule-based process | P |
| ||||||||||||||
GO:0007067 | mitosis | P |
| ||||||||||||||
GO:0009416 | response to light stimulus | P |
| ||||||||||||||
GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||
GO:0009826 | unidimensional cell growth | P |
| ||||||||||||||
GO:0016203 | muscle attachment | P |
| ||||||||||||||
GO:0030473 | nuclear migration along microtubule | P |
| ||||||||||||||
GO:0042267 | natural killer cell mediated cytotoxicity | P |
| ||||||||||||||
GO:0045143 | homologous chromosome segregation | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_204 | ![]() |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Anopheles gambiae (Aga) | aga7941 | ENSANGP00000002671 | |
Anopheles gambiae (Aga) | aga10639 | ENSANGP00000013034 | |
Ashbya gossypii (Ago) | ago1272 | ACR225C | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath2147 | At1g20010.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath6893 | At1g75780.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath9924 | At2g29550.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath19994 | At4g20890.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath23443 | At5g12250.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath24638 | At5g23860.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath26262 | At5g44340.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath28381 | At5g62690.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath28382 | At5g62700.1 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel258 | B0272.1 (CE00850; WBGene00006538) | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel4692 | C54C6.2 (CE33770; WBGene00000248) | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl4063 | CAGL0K12650g | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne5438 | 179.m00290 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi11456 | DDB0191169 | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha2726 | DEHA0D09724g | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme6053 | CG9277-PA (FBgn0003887) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme6050 | CG9277-PB (FBgn0003887) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme6051 | CG9277-PC (FBgn0003887) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme6052 | CG9277-PD (FBgn0003887) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme11691 | CG9359-PA (FBgn0003889) | |
Danio rerio (Dre) | dre19446 | ENSDARP00000022281 | |
Danio rerio (Dre) | dre4786 | ENSDARP00000024339 | |
Danio rerio (Dre) | dre15741 | ENSDARP00000026729 | |
Encephalitozoon cuniculi (Ecu) | ecu447 | 19173040 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru26108 | SINFRUP00000135521 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru21784 | SINFRUP00000135523 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru27177 | SINFRUP00000139597 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru1850 | SINFRUP00000151845 | |
Gallus gallus (Gga) | gga8164 | ENSGALP00000013964 (TUBB2C) | |
Gallus gallus (Gga) | gga10526 | ENSGALP00000020884 | P09203 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa24952 | ENSP00000248151 (TUBB4Q) | Q99867 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa26370 | ENSP00000259818 (TUBB2B) | Q9BVA1 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa26776 | ENSP00000259925 | |
Homo sapiens (Hsa) | hsa15452 | ENSP00000264071 (TUBB4) | P04350 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa32326 | ENSP00000290377 (TUBBP5) | A6NKZ8 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa14644 | ENSP00000309431 | A6NNZ2 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa3416 | ENSP00000311042 | |
Homo sapiens (Hsa) | hsa12712 | ENSP00000320295 (TUBB3) | Q13509 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa12725 | ENSP00000328808 (RP11-631M21.2) | Q3ZCM7 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa32296 | ENSP00000341289 (TUBB2C) | P68371 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla2294 | KLLA0D05269g | |
Mus musculus (Mmu) | mmu11581 | ENSMUSP00000001566 (MGI:107812) | P99024 |
Mus musculus (Mmu) | mmu14192 | ENSMUSP00000042342 (MGI:1915472) | P68372 |
Mus musculus (Mmu) | mmu26869 | ENSMUSP00000071134 (MGI:107813) | Q9ERD7 |
Mus musculus (Mmu) | mmu11983 | ENSMUSP00000071135 (MGI:107848) | Q9D6F9 |
Mus musculus (Mmu) | mmu6817 | ENSMUSP00000075178 (MGI:1920960) | Q9CWF2 |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr3930 | NCU04054.2 | |
Oryza sativa (Osa) | osa11459 | 2774.m00146 | |
Oryza sativa (Osa) | osa13593 | 2868.m00165 | |
Oryza sativa (Osa) | osa34701 | 4710.m00161 | |
Oryza sativa (Osa) | osa34584 | 4753.m00190 | |
Oryza sativa (Osa) | osa34627 | 4753.m00233 | |
Oryza sativa (Osa) | osa49576 | 5740.m00187 | |
Oryza sativa (Osa) | osa49148 | 5836.m00138 | |
Oryza sativa (Osa) | osa53806 | 6142.m00169 | |
Oryza sativa (Osa) | osa57730 | 6241.m00139 | |
Oryza sativa (Osa) | osa63798 | 6746.m00163 | |
Oryza sativa (Osa) | osa144 | 748.m00179 | |
Oryza sativa (Osa) | osa184 | 748.m00252 | |
Oryza sativa (Osa) | osa86723 | 9210.m00126 | |
Oryza sativa (Osa) | osa87783 | 9527.m00177 | |
Oryza sativa (Osa) | osa88096 | 9540.m00249 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa306 | PF10_0084 | |
Rattus norvegicus (Rno) | rno17381 | ENSRNOP00000001095 (RGD:628596) | P69897-1 |
Rattus norvegicus (Rno) | rno18131 | ENSRNOP00000013863 (RGD:735101) | Q6P9T8 |
Rattus norvegicus (Rno) | rno15174 | ENSRNOP00000023452 (RGD:628595) | Q4QRB4 |
Rattus norvegicus (Rno) | rno13231 | ENSRNOP00000023582 (RGD:1309427) | Q3KRE8 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce1992 | YFL037W (S000001857) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo4783 | SPBC26H8.07c | P05219 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli3886 | YALI0E00726g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005618 | cell wall | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005622 | intracellular | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005773 | vacuole | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005816 | spindle pole body | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005827 | polar microtubule | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005828 | kinetochore microtubule | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005874 | microtubule | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005880 | nuclear microtubule | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005881 | cytoplasmic microtubule | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
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GO:0005929 | cilium | C |
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GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0015630 | microtubule cytoskeleton | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030424 | axon | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0033269 | internode region of axon | C |
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GO:0042995 | cell projection | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0043025 | neuronal cell body | C |
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GO:0043209 | myelin sheath | C |
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GO:0043234 | protein complex | C |
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GO:0045298 | tubulin complex | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005198 | structural molecule activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0032403 | protein complex binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042277 | peptide binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0000226 | microtubule cytoskeleton organization | P |
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GO:0000743 | nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0001764 | neuron migration | P |
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GO:0002009 | morphogenesis of an epithelium | P |
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GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0007017 | microtubule-based process | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0007067 | mitosis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0007163 | establishment or maintenance of cell polarity | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0007411 | axon guidance | P |
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GO:0007435 | salivary gland morphogenesis | P |
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GO:0007635 | chemosensory behavior | P |
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GO:0009409 | response to cold | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009416 | response to light stimulus | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009651 | response to salt stress | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0009826 | unidimensional cell growth | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016203 | muscle attachment | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030182 | neuron differentiation | P |
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GO:0030473 | nuclear migration along microtubule | P |
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GO:0035046 | pronuclear migration | P |
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GO:0040007 | growth | P |
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GO:0040018 | positive regulation of multicellular organism growth | P |
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GO:0040035 | hermaphrodite genitalia development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0045143 | homologous chromosome segregation | P |
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GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
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GO:0051225 | spindle assembly | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPBC26H8.07c (P05219) | YFL037W (S000001857) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||
GO:0005816 | spindle pole body | C |
| ||||||||
GO:0005827 | polar microtubule | C |
| ||||||||
GO:0005828 | kinetochore microtubule | C |
| ||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||
GO:0005874 | microtubule | C |
| ||||||||
GO:0005880 | nuclear microtubule | C |
| ||||||||
GO:0005881 | cytoplasmic microtubule | C |
| ||||||||
GO:0045298 | tubulin complex | C |
| ||||||||
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton | F |
| ||||||||
GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||
GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
| ||||||||
GO:0000226 | microtubule cytoskeleton organization | P |
| ||||||||
GO:0000743 | nuclear migration involved in conjugation with cellular fusion | P |
| ||||||||
GO:0007163 | establishment or maintenance of cell polarity | P |
| ||||||||
GO:0030473 | nuclear migration along microtubule | P |
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GO:0045143 | homologous chromosome segregation | P |
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