| YOGY Home | YOGY Help |
|
| KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
| KOG0084 | ACDHYPE![]() |
| KOGs classification | KOGs description |
| CELLULAR PROCESSES AND SIGNALINGCELLULAR PROCESSES AND SIGNALING | GTPase Rab1/YPT1, small G protein superfamily, and related GTP-binding proteins |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
| GO:0000139 | Golgi membrane | C |
| ||||||||||||||
| GO:0000407 | pre-autophagosomal structure | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005773 | vacuole | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005794 | Golgi apparatus | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005795 | Golgi stack | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005802 | trans-Golgi network | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||
| GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||
| GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||
| GO:0019867 | outer membrane | C |
| ||||||||||||||
| GO:0031968 | organelle outer membrane | C |
| ||||||||||||||
| GO:0000149 | SNARE binding | F |
| ||||||||||||||
| GO:0003924 | GTPase activity | F |
| ||||||||||||||
| GO:0005097 | Rab GTPase activator activity | F |
| ||||||||||||||
| GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||
| GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||||||||
| GO:0030742 | GTP-dependent protein binding | F |
| ||||||||||||||
| GO:0080115 | myosin XI tail binding | F |
| ||||||||||||||
| GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||
| GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||
| GO:0006184 | GTP catabolic process | P |
| ||||||||||||||
| GO:0006461 | protein complex assembly | P |
| ||||||||||||||
| GO:0006886 | intracellular protein transport | P |
| ||||||||||||||
| GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||
| GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||||||||
| GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||
| GO:0007264 | small GTPase mediated signal transduction | P |
| ||||||||||||||
| GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||
| GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||
| GO:0015031 | protein transport | P |
| ||||||||||||||
| GO:0016050 | vesicle organization | P |
| ||||||||||||||
| GO:0016192 | vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||
| GO:0016236 | macroautophagy | P |
| ||||||||||||||
| GO:0018996 | molting cycle, collagen and cuticulin-based cuticle | P |
| ||||||||||||||
| GO:0032258 | CVT pathway | P |
| ||||||||||||||
| GO:0032456 | endocytic recycling | P |
| ||||||||||||||
| GO:0034498 | early endosome to Golgi transport | P |
| ||||||||||||||
| GO:0035494 | SNARE complex disassembly | P |
| ||||||||||||||
| GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||
| GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||
| GO:0045184 | establishment of protein localization | P |
| ||||||||||||||
| GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
| ||||||||||||||
| GO:0048194 | Golgi vesicle budding | P |
| ||||||||||||||
| GO:0048211 | Golgi vesicle docking | P |
| ||||||||||||||
| GO:0048284 | organelle fusion | P |
| ||||||||||||||
| GO:0048477 | oogenesis | P |
| ||||||||||||||
| GO:0070317 | negative regulation of G0 to G1 transition | P |
| ||||||||||||||
| GO:0090114 | COPII-coated vesicle budding | P |
|
| HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
| 36154 | ![]() |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000139 | Golgi membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000407 | pre-autophagosomal structure | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005625 | soluble fraction | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005626 | insoluble fraction | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005773 | vacuole | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005794 | Golgi apparatus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005795 | Golgi stack | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005802 | trans-Golgi network | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005811 | lipid particle | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0019867 | outer membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031968 | organelle outer membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0043025 | neuronal cell body | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000149 | SNARE binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003924 | GTPase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006184 | GTP catabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006461 | protein complex assembly | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006886 | intracellular protein transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007015 | actin filament organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007155 | cell adhesion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007264 | small GTPase mediated signal transduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008360 | regulation of cell shape | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009306 | protein secretion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0015031 | protein transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016050 | vesicle organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016192 | vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016236 | macroautophagy | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0018996 | molting cycle, collagen and cuticulin-based cuticle | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0032258 | CVT pathway | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0032456 | endocytic recycling | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0034498 | early endosome to Golgi transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0035494 | SNARE complex disassembly | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0045184 | establishment of protein localization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048194 | Golgi vesicle budding | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048211 | Golgi vesicle docking | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048284 | organelle fusion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048477 | oogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0050774 | negative regulation of dendrite morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0070317 | negative regulation of G0 to G1 transition | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0090114 | COPII-coated vesicle budding | P |
|
| OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
| OG1_633 | ![]() |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000139 | Golgi membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000407 | pre-autophagosomal structure | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005625 | soluble fraction | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005626 | insoluble fraction | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005773 | vacuole | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005794 | Golgi apparatus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005795 | Golgi stack | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005802 | trans-Golgi network | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005811 | lipid particle | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0019867 | outer membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031968 | organelle outer membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0043025 | neuronal cell body | C |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000149 | SNARE binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003924 | GTPase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0030742 | GTP-dependent protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0080115 | myosin XI tail binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006184 | GTP catabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006461 | protein complex assembly | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006886 | intracellular protein transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007015 | actin filament organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007155 | cell adhesion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007264 | small GTPase mediated signal transduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008150 | biological_process | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008360 | regulation of cell shape | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009306 | protein secretion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0015031 | protein transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016050 | vesicle organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016192 | vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016236 | macroautophagy | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0018996 | molting cycle, collagen and cuticulin-based cuticle | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0032258 | CVT pathway | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0032456 | endocytic recycling | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0034498 | early endosome to Golgi transport | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0035494 | SNARE complex disassembly | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0045184 | establishment of protein localization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048194 | Golgi vesicle budding | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048211 | Golgi vesicle docking | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048284 | organelle fusion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048477 | oogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0050774 | negative regulation of dendrite morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0070317 | negative regulation of G0 to G1 transition | P |
| ||||||||||||||||||||||||||
| GO:0090114 | COPII-coated vesicle budding | P |
|
Curated yeast ortholog results:
| S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
| SPBC1703.10 (P11620) | YFL038C (S000001856) |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||
| GO:0000139 | Golgi membrane | C |
| ||||||||
| GO:0000407 | pre-autophagosomal structure | C |
| ||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||
| GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||
| GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | C |
| ||||||||
| GO:0005795 | Golgi stack | C |
| ||||||||
| GO:0005802 | trans-Golgi network | C |
| ||||||||
| GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||
| GO:0019867 | outer membrane | C |
| ||||||||
| GO:0031968 | organelle outer membrane | C |
| ||||||||
| GO:0000149 | SNARE binding | F |
| ||||||||
| GO:0003924 | GTPase activity | F |
| ||||||||
| GO:0005525 | GTP binding | F |
| ||||||||
| GO:0006184 | GTP catabolic process | P |
| ||||||||
| GO:0006461 | protein complex assembly | P |
| ||||||||
| GO:0006886 | intracellular protein transport | P |
| ||||||||
| GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||
| GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||
| GO:0007264 | small GTPase mediated signal transduction | P |
| ||||||||
| GO:0015031 | protein transport | P |
| ||||||||
| GO:0016050 | vesicle organization | P |
| ||||||||
| GO:0016192 | vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||
| GO:0016236 | macroautophagy | P |
| ||||||||
| GO:0032258 | CVT pathway | P |
| ||||||||
| GO:0032456 | endocytic recycling | P |
| ||||||||
| GO:0034498 | early endosome to Golgi transport | P |
| ||||||||
| GO:0035494 | SNARE complex disassembly | P |
| ||||||||
| GO:0045184 | establishment of protein localization | P |
| ||||||||
| GO:0048194 | Golgi vesicle budding | P |
| ||||||||
| GO:0048211 | Golgi vesicle docking | P |
| ||||||||
| GO:0048284 | organelle fusion | P |
| ||||||||
| GO:0070317 | negative regulation of G0 to G1 transition | P |
| ||||||||
| GO:0090114 | COPII-coated vesicle budding | P |
|
| YOGY Home | YOGY Help |
| s.khadayate@ucl.ac.uk |