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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG0417 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
CELLULAR PROCESSES AND SIGNALING | Ubiquitin-protein ligase |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0000151 | ubiquitin ligase complex | C |
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GO:0000502 | proteasome complex | C |
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GO:0005575 | cellular_component | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005654 | nucleoplasm | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005773 | vacuole | C |
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GO:0005777 | peroxisome | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0005886 | plasma membrane | C |
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GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | C |
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GO:0031371 | ubiquitin conjugating enzyme complex | C |
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GO:0031372 | UBC13-MMS2 complex | C |
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GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0019787 | small conjugating protein ligase activity | F |
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GO:0031625 | ubiquitin protein ligase binding | F |
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GO:0042296 | ISG15 ligase activity | F |
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GO:0042803 | protein homodimerization activity | F |
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GO:0043130 | ubiquitin binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000070 | mitotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0000209 | protein polyubiquitination | P |
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GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | P |
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GO:0000729 | DNA double-strand break processing | P |
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GO:0002119 | nematode larval development | P |
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GO:0006282 | regulation of DNA repair | P |
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GO:0006301 | postreplication repair | P |
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GO:0006414 | translational elongation | P |
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GO:0006464 | protein modification process | P |
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GO:0006508 | proteolysis | P |
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GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
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GO:0006513 | protein monoubiquitination | P |
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GO:0006635 | fatty acid beta-oxidation | P |
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GO:0006914 | autophagy | P |
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GO:0006915 | apoptosis | P |
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GO:0006917 | induction of apoptosis | P |
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GO:0006950 | response to stress | P |
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GO:0007031 | peroxisome organization | P |
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GO:0007039 | vacuolar protein catabolic process | P |
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GO:0007126 | meiosis | P |
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GO:0007281 | germ cell development | P |
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GO:0007409 | axonogenesis | P |
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GO:0007412 | axon target recognition | P |
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GO:0007625 | grooming behavior | P |
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GO:0007629 | flight behavior | P |
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GO:0007630 | jump response | P |
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GO:0008054 | cyclin catabolic process | P |
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GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
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GO:0008594 | photoreceptor cell morphogenesis | P |
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GO:0009266 | response to temperature stimulus | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0010039 | response to iron ion | P |
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GO:0010053 | root epidermal cell differentiation | P |
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GO:0010099 | regulation of photomorphogenesis | P |
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GO:0010390 | histone monoubiquitination | P |
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GO:0010994 | free ubiquitin chain polymerization | P |
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GO:0016558 | protein import into peroxisome matrix | P |
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GO:0016562 | protein import into peroxisome matrix, receptor recycling | P |
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GO:0016567 | protein ubiquitination | P |
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GO:0016574 | histone ubiquitination | P |
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GO:0019915 | lipid storage | P |
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GO:0030509 | BMP signaling pathway | P |
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GO:0031058 | positive regulation of histone modification | P |
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GO:0031145 | anaphase-promoting complex-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process | P |
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GO:0031398 | positive regulation of protein ubiquitination | P |
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GO:0032020 | ISG15-protein conjugation | P |
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GO:0033182 | regulation of histone ubiquitination | P |
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GO:0033523 | histone H2B ubiquitination | P |
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GO:0035519 | protein K29-linked ubiquitination | P |
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GO:0040007 | growth | P |
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GO:0040011 | locomotion | P |
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GO:0040035 | hermaphrodite genitalia development | P |
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GO:0042221 | response to chemical stimulus | P |
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GO:0043123 | positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade | P |
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GO:0043162 | ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway | P |
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GO:0044314 | protein K27-linked ubiquitination | P |
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GO:0045739 | positive regulation of DNA repair | P |
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GO:0046668 | regulation of retinal cell programmed cell death | P |
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GO:0046675 | induction of compound eye retinal cell programmed cell death | P |
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GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
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GO:0050852 | T cell receptor signaling pathway | P |
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GO:0051092 | positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity | P |
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GO:0051436 | negative regulation of ubiquitin-protein ligase activity involved in mitotic cell cycle | P |
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GO:0051437 | positive regulation of ubiquitin-protein ligase activity involved in mitotic cell cycle | P |
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GO:0051443 | positive regulation of ubiquitin-protein ligase activity | P |
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GO:0051865 | protein autoubiquitination | P |
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GO:0070534 | protein K63-linked ubiquitination | P |
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GO:0070936 | protein K48-linked ubiquitination | P |
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GO:0070979 | protein K11-linked ubiquitination | P |
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GO:0085020 | protein K6-linked ubiquitination | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
39129 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | PEX4 (S000003365) | GI:6321572 | P29340 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0E03916g | GI:50308249 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_AFR314W | GI:45198832 | |
Magnaporthe grisea (Mgr) | MGG_00180 | GI:39975347 | |
Neurospora crassa (Ncr) | NCU02636.1 | GI:32422783 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||
GO:0005777 | peroxisome | C |
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GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F |
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GO:0000209 | protein polyubiquitination | P |
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GO:0006414 | translational elongation | P |
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GO:0006513 | protein monoubiquitination | P |
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GO:0007031 | peroxisome organization | P |
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GO:0016562 | protein import into peroxisome matrix, receptor recycling | P |
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GO:0051865 | protein autoubiquitination | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_5602 | ![]() |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Ashbya gossypii (Ago) | ago3506 | AFR314W | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath24847 | At5g25760.1 | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl2973 | CAGL0I10450g | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi3040 | DDB0167874 | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha2991 | DEHA0D15444g | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla3124 | KLLA0E03916g | |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr2554 | NCU02636.2 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa3026 | PFF0305c | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce2505 | YGR133W (S000003365) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo2554 | SPBC1198.09 | Q9P6I1 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli4053 | YALI0E04620g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005777 | peroxisome | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0000209 | protein polyubiquitination | P |
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GO:0006414 | translational elongation | P |
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GO:0006513 | protein monoubiquitination | P |
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GO:0006635 | fatty acid beta-oxidation | P |
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GO:0007031 | peroxisome organization | P |
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GO:0016558 | protein import into peroxisome matrix | P |
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GO:0016562 | protein import into peroxisome matrix, receptor recycling | P |
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GO:0016567 | protein ubiquitination | P |
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GO:0051865 | protein autoubiquitination | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPBC1198.09 (Q9P6I1) | YGR133W (S000003365) |
SPAC1250.03 (Q9UTN8) | YGR133W (S000003365) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005777 | peroxisome | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0004842 | ubiquitin-protein ligase activity | F |
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GO:0000209 | protein polyubiquitination | P |
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GO:0006414 | translational elongation | P |
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GO:0006513 | protein monoubiquitination | P |
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GO:0007031 | peroxisome organization | P |
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GO:0016562 | protein import into peroxisome matrix, receptor recycling | P |
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GO:0016567 | protein ubiquitination | P |
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GO:0051865 | protein autoubiquitination | P |
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