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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG2960 | A---YP- |
KOGs classification | KOGs description |
POORLY CHARACTERIZED | Protein involved in thiamine biosynthesis and DNA damage tolerance |
Species | KOG link | NCBI link | UniProt link |
Arabidopsis thaliana (Ath) | At5g54770 | GI:15239735 | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | YGR144w (S000003376) | GI:6321583 | P32318 |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | SPBC26H8.01 | GI:19113434 | P40998 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||
GO:0009570 | chloroplast stroma | C |
| ||||||||||||||
GO:0009579 | thylakoid | C |
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GO:0009941 | chloroplast envelope | C |
| ||||||||||||||
GO:0010319 | stromule | C |
| ||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||
GO:0008270 | zinc ion binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0042803 | protein homodimerization activity | F |
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GO:0000002 | mitochondrial genome maintenance | P |
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GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
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GO:0009228 | thiamin biosynthetic process | P |
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GO:0009409 | response to cold | P |
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GO:0018131 | oxazole or thiazole biosynthetic process | P |
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GO:0042176 | regulation of protein catabolic process | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
5997 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0009507 | chloroplast | C |
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GO:0009570 | chloroplast stroma | C |
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GO:0009579 | thylakoid | C |
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GO:0009941 | chloroplast envelope | C |
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GO:0010319 | stromule | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0008270 | zinc ion binding | F |
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GO:0042803 | protein homodimerization activity | F |
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GO:0000002 | mitochondrial genome maintenance | P |
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GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
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GO:0009228 | thiamin biosynthetic process | P |
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GO:0009409 | response to cold | P |
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GO:0018131 | oxazole or thiazole biosynthetic process | P |
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GO:0042176 | regulation of protein catabolic process | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_6367 |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Ashbya gossypii (Ago) | ago50 | AAL137W | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath27462 | At5g54770.1 | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl4705 | CAGL0M01166g | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha5195 | DEHA0F18095g | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla5 | KLLA0A00198g | |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr5937 | NCU06110.2 | |
Oryza sativa (Osa) | osa3524 | 2036.m00109 | |
Oryza sativa (Osa) | osa3527 | 2036.m00129 | |
Oryza sativa (Osa) | osa4666 | 2116.m00097 | |
Oryza sativa (Osa) | osa67395 | 6955.m00133 | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce2516 | YGR144W (S000003376) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo4757 | SPBC26H8.01 | P40998 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli323 | YALI0A09768g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0009507 | chloroplast | C |
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GO:0009570 | chloroplast stroma | C |
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GO:0009579 | thylakoid | C |
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GO:0009941 | chloroplast envelope | C |
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GO:0010319 | stromule | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0008270 | zinc ion binding | F |
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GO:0042803 | protein homodimerization activity | F |
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GO:0000002 | mitochondrial genome maintenance | P |
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GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
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GO:0009228 | thiamin biosynthetic process | P |
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GO:0009409 | response to cold | P |
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GO:0018131 | oxazole or thiazole biosynthetic process | P |
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GO:0042176 | regulation of protein catabolic process | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPBC26H8.01 (P40998) | YGR144W (S000003376) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0000002 | mitochondrial genome maintenance | P |
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GO:0009228 | thiamin biosynthetic process | P |
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GO:0018131 | oxazole or thiazole biosynthetic process | P |
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GO:0042176 | regulation of protein catabolic process | P |
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