YOGY Home | YOGY Help |
|
KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG0907 | ACDHYP-![]() |
KOGs classification | KOGs description |
CELLULAR PROCESSES AND SIGNALING | Thioredoxin |
HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
55732 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Homo sapiens (Hsa) | TXN | GI:50592994 | |
Pan troglodytes (Ptr) | TXN | GI:114626146 | |
Mus musculus (Mmu) | Txn1 (MGI:98874) | GI:6755911 | P10639 |
Rattus norvegicus (Rno) | Txn1 (RGD:621157) | GI:16758644 | |
Gallus gallus (Gga) | TXN | GI:45382053 | |
Drosophila melanogaster (Dme) | Trx-2 (FBgn0040070) | GI:17648013 | |
Anopheles gambiae (Aga) | TRX1 | GI:118790467 | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | trx1 (SPAC7D4.07c) | GI:19114764 | O14463 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | TRX2 (S000003441) | GI:6321648 | P22803 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | TRX1 (S000004033) | GI:6323072 | P22217 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | KLLA0E16401g | GI:50309357 | |
Eremothecium gossypii (Ego) | AGOS_ACL131W | GI:45185557 | |
Magnaporthe grisea (Mgr) | MGG_04236 | GI:39944450 | |
Neurospora crassa (Ncr) | NCU06556.1 | GI:32411861 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ATTRX2 | GI:15242525 | |
Oryza sativa (Osa) | Os03g0800700 | GI:115455973 | |
Oryza sativa (Osa) | Os07g0190800 | GI:115470983 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | PF14_0545 | GI:124809933 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||
GO:0000324 | fungal-type vacuole | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||
GO:0015035 | protein disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0015036 | disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0015037 | peptide disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0016209 | antioxidant activity | F |
| ||||||||||||||||
GO:0016671 | oxidoreductase activity, acting on sulfur group of donors, disulfide as acceptor | F |
| ||||||||||||||||
GO:0000011 | vacuole inheritance | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000103 | sulfate assimilation | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000122 | negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006275 | regulation of DNA replication | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006467 | protein thiol-disulfide exchange | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006508 | proteolysis | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006928 | cellular component movement | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006979 | response to oxidative stress | P |
| ||||||||||||||||
GO:0007039 | vacuolar protein catabolic process | P |
| ||||||||||||||||
GO:0007165 | signal transduction | P |
| ||||||||||||||||
GO:0007267 | cell-cell signaling | P |
| ||||||||||||||||
GO:0008152 | metabolic process | P |
| ||||||||||||||||
GO:0008283 | cell proliferation | P |
| ||||||||||||||||
GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||
GO:0034599 | cellular response to oxidative stress | P |
| ||||||||||||||||
GO:0034614 | cellular response to reactive oxygen species | P |
| ||||||||||||||||
GO:0042144 | vacuole fusion, non-autophagic | P |
| ||||||||||||||||
GO:0045454 | cell redox homeostasis | P |
| ||||||||||||||||
GO:0046826 | negative regulation of protein export from nucleus | P |
| ||||||||||||||||
GO:0080058 | protein amino acid deglutathionylation | P |
| ||||||||||||||||
GO:0090329 | regulation of DNA-dependent DNA replication | P |
|
OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_100 | ![]() |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Anopheles gambiae (Aga) | aga5715 | ENSANGP00000014381 | |
Anopheles gambiae (Aga) | aga2646 | ENSANGP00000018892 | |
Anopheles gambiae (Aga) | aga11764 | ENSANGP00000021044 | |
Anopheles gambiae (Aga) | aga14361 | ENSANGP00000027639 | |
Ashbya gossypii (Ago) | ago918 | ACL131W | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath304 | At1g03680.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath2119 | At1g19730.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath3939 | At1g45145.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath5157 | At1g59730.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath6261 | At1g69880.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath13760 | At3g15360.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath16419 | At3g51030.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath18258 | At4g03520.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath25767 | At5g39950.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath26104 | At5g42980.1 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel79 | B0024.9 (CE05153; WBGene00007099) | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel200 | B0228.5a (CE01745; WBGene00015062) | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel201 | B0228.5b (CE34629) | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel19907 | Y55F3AR.2 (CE34418; WBGene00021933) | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl966 | CAGL0E00583g | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl3554 | CAGL0K00803g | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne5262 | 179.m00111 | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne5510 | 179.m00363 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi7712 | DDB0186269 | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha1683 | DEHA0C05676g | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha5925 | DEHA0G05126g | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme9509 | CG13473-PA (FBgn0036442) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme1621 | CG31884-PA (FBgn0040070) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme1620 | CG31884-PB (FBgn0040070) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme16554 | CG3315-PA (FBgn0029752) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme7586 | CG8993-PA (FBgn0035334) | |
Danio rerio (Dre) | dre21166 | ENSDARP00000025425 | |
Danio rerio (Dre) | dre862 | ENSDARP00000045696 (zgc:56493) | Q7ZUI4 |
Escherichia coli (Eco) | eco3651 | 16131637 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru28372 | SINFRUP00000128109 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru19002 | SINFRUP00000144335 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru28373 | SINFRUP00000167949 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru28374 | SINFRUP00000171785 | |
Gallus gallus (Gga) | gga971 | ENSGALP00000020443 (TXN2) | |
Gallus gallus (Gga) | gga972 | ENSGALP00000020444 (TXN2) | Q5ZJY6 |
Gallus gallus (Gga) | gga28058 | ENSGALP00000025280 (TXN) | P08629 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa21584 | ENSP00000216185 (TXN2) | Q99757 |
Homo sapiens (Hsa) | hsa31710 | ENSP00000259332 | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla3685 | KLLA0E16401g | |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla4551 | KLLA0F10351g | |
Mus musculus (Mmu) | mmu9248 | ENSMUSP00000005487 (MGI:1929468) | P97493 |
Mus musculus (Mmu) | mmu18190 | ENSMUSP00000040549 (MGI:1914652) | A2AV98 |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr581 | NCU00598.2 | |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr5569 | NCU05731.2 | |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr6374 | NCU06556.2 | |
Oryza sativa (Osa) | osa4386 | 2224.m00077 | |
Oryza sativa (Osa) | osa20517 | 3433.m00111 | |
Oryza sativa (Osa) | osa25198 | 3840.m00219 | |
Oryza sativa (Osa) | osa24389 | 3860.m00154 | |
Oryza sativa (Osa) | osa34204 | 4684.m00160 | |
Oryza sativa (Osa) | osa48936 | 5830.m00153 | |
Oryza sativa (Osa) | osa62600 | 6678.m00164 | |
Oryza sativa (Osa) | osa73069 | 7268.m00124 | |
Oryza sativa (Osa) | osa79864 | 8146.m00147 | |
Oryza sativa (Osa) | osa84174 | 8308.m00161 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa1264 | PF14_0545 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa4716 | PFI1250w | |
Rattus norvegicus (Rno) | rno27338 | ENSRNOP00000007537 (RGD:71040) | |
Rattus norvegicus (Rno) | rno23187 | ENSRNOP00000016447 (RGD:621157) | P11232 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce739 | YCR083W (S000000679) | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce2590 | YGR209C (S000003441) | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce4124 | YLR043C (S000004033) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo464 | SPAC7D4.07c | O14463 |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo1732 | SPBC12D12.07c | O94504 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli4836 | YALI0E23540g | |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli5394 | YALI0F01496g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||
GO:0000324 | fungal-type vacuole | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0000806 | Y chromosome | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005618 | cell wall | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005773 | vacuole | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005794 | Golgi apparatus | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009570 | chloroplast stroma | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009579 | thylakoid | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009941 | chloroplast envelope | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010319 | stromule | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0043025 | neuronal cell body | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0048046 | apoplast | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008047 | enzyme activator activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008113 | peptide-methionine-(S)-S-oxide reductase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0015035 | protein disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0015036 | disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016209 | antioxidant activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016491 | oxidoreductase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016671 | oxidoreductase activity, acting on sulfur group of donors, disulfide as acceptor | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0032403 | protein complex binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0033743 | peptide-methionine (R)-S-oxide reductase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0000011 | vacuole inheritance | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0000050 | urea cycle | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0000103 | sulfate assimilation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0001675 | acrosome assembly | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006275 | regulation of DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006457 | protein folding | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006467 | protein thiol-disulfide exchange | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006508 | proteolysis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006979 | response to oxidative stress | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0007039 | vacuolar protein catabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009409 | response to cold | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0010188 | response to microbial phytotoxin | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0034599 | cellular response to oxidative stress | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0034614 | cellular response to reactive oxygen species | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042144 | vacuole fusion, non-autophagic | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042450 | arginine biosynthetic process via ornithine | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042542 | response to hydrogen peroxide | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0043085 | positive regulation of catalytic activity | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0045454 | cell redox homeostasis | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0046686 | response to cadmium ion | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0050832 | defense response to fungus | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0055114 | oxidation reduction | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0080058 | protein amino acid deglutathionylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0090329 | regulation of DNA-dependent DNA replication | P |
|
Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPAC7D4.07c (O14463) | YGR209C (S000003441) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||
GO:0000324 | fungal-type vacuole | C |
| ||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||
GO:0015035 | protein disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||
GO:0015036 | disulfide oxidoreductase activity | F |
| ||||||||
GO:0016209 | antioxidant activity | F |
| ||||||||
GO:0000011 | vacuole inheritance | P |
| ||||||||
GO:0000103 | sulfate assimilation | P |
| ||||||||
GO:0006275 | regulation of DNA replication | P |
| ||||||||
GO:0006467 | protein thiol-disulfide exchange | P |
| ||||||||
GO:0006508 | proteolysis | P |
| ||||||||
GO:0006888 | ER to Golgi vesicle-mediated transport | P |
| ||||||||
GO:0006890 | retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to ER | P |
| ||||||||
GO:0007039 | vacuolar protein catabolic process | P |
| ||||||||
GO:0034599 | cellular response to oxidative stress | P |
| ||||||||
GO:0034614 | cellular response to reactive oxygen species | P |
| ||||||||
GO:0042144 | vacuole fusion, non-autophagic | P |
| ||||||||
GO:0045454 | cell redox homeostasis | P |
| ||||||||
GO:0080058 | protein amino acid deglutathionylation | P |
| ||||||||
GO:0090329 | regulation of DNA-dependent DNA replication | P |
|
YOGY Home | YOGY Help |
s.khadayate@ucl.ac.uk |