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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG1782 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | Small Nuclear ribonucleoprotein splicing factor |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||
GO:0000932 | cytoplasmic mRNA processing body | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005732 | small nucleolar ribonucleoprotein complex | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||
GO:0005845 | mRNA cap binding complex | C |
| ||||||||||||||||
GO:0030532 | small nuclear ribonucleoprotein complex | C |
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GO:0046540 | U4/U6 x U5 tri-snRNP complex | C |
| ||||||||||||||||
GO:0000339 | RNA cap binding | F |
| ||||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||
GO:0003723 | RNA binding | F |
| ||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||
GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000288 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000290 | deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000375 | RNA splicing, via transesterification reactions | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000377 | RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile | P |
| ||||||||||||||||
GO:0000398 | nuclear mRNA splicing, via spliceosome | P |
| ||||||||||||||||
GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006364 | rRNA processing | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006397 | mRNA processing | P |
| ||||||||||||||||
GO:0006401 | RNA catabolic process | P |
| ||||||||||||||||
GO:0008150 | biological_process | P |
| ||||||||||||||||
GO:0008380 | RNA splicing | P |
| ||||||||||||||||
GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||
GO:0034622 | cellular macromolecular complex assembly | P |
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GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||
GO:0071044 | histone mRNA catabolic process | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
40945 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||
GO:0000932 | cytoplasmic mRNA processing body | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
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GO:0005732 | small nucleolar ribonucleoprotein complex | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0005845 | mRNA cap binding complex | C |
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GO:0030532 | small nuclear ribonucleoprotein complex | C |
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GO:0046540 | U4/U6 x U5 tri-snRNP complex | C |
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GO:0000339 | RNA cap binding | F |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0003723 | RNA binding | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000288 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay | P |
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GO:0000290 | deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA | P |
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GO:0000375 | RNA splicing, via transesterification reactions | P |
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GO:0000377 | RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile | P |
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GO:0000398 | nuclear mRNA splicing, via spliceosome | P |
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GO:0002119 | nematode larval development | P |
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GO:0006364 | rRNA processing | P |
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GO:0006397 | mRNA processing | P |
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GO:0006401 | RNA catabolic process | P |
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GO:0008150 | biological_process | P |
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GO:0008380 | RNA splicing | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0034622 | cellular macromolecular complex assembly | P |
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GO:0040007 | growth | P |
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GO:0071044 | histone mRNA catabolic process | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_2675 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||
GO:0000932 | cytoplasmic mRNA processing body | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
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GO:0005732 | small nucleolar ribonucleoprotein complex | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0005845 | mRNA cap binding complex | C |
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GO:0030532 | small nuclear ribonucleoprotein complex | C |
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GO:0046540 | U4/U6 x U5 tri-snRNP complex | C |
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GO:0000339 | RNA cap binding | F |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0003723 | RNA binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000288 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay | P |
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GO:0000290 | deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA | P |
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GO:0000375 | RNA splicing, via transesterification reactions | P |
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GO:0000377 | RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile | P |
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GO:0000398 | nuclear mRNA splicing, via spliceosome | P |
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GO:0002119 | nematode larval development | P |
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GO:0006364 | rRNA processing | P |
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GO:0006397 | mRNA processing | P |
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GO:0006401 | RNA catabolic process | P |
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GO:0008150 | biological_process | P |
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GO:0008380 | RNA splicing | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0034622 | cellular macromolecular complex assembly | P |
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GO:0040007 | growth | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPBC3D6.08c (P87173) | YJL124C (S000003660) |