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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG0355 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | DNA topoisomerase type II |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||
GO:0000228 | nuclear chromosome | C |
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GO:0000792 | heterochromatin | C |
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GO:0000795 | synaptonemal complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005654 | nucleoplasm | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0005814 | centriole | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0005886 | plasma membrane | C |
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GO:0009295 | nucleoid | C |
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GO:0009330 | DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) | C |
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GO:0009507 | chloroplast | C |
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GO:0019035 | viral integration complex | C |
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GO:0043234 | protein complex | C |
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GO:0070603 | SWI/SNF-type complex | C |
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GO:0003677 | DNA binding | F |
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GO:0003682 | chromatin binding | F |
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GO:0003824 | catalytic activity | F |
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GO:0003916 | DNA topoisomerase activity | F |
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GO:0003918 | DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity | F |
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GO:0005080 | protein kinase C binding | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0005524 | ATP binding | F |
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GO:0008022 | protein C-terminus binding | F |
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GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
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GO:0008144 | drug binding | F |
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GO:0019899 | enzyme binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042803 | protein homodimerization activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042826 | histone deacetylase binding | F |
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GO:0043130 | ubiquitin binding | F |
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GO:0046982 | protein heterodimerization activity | F |
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GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
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GO:0000712 | resolution of meiotic recombination intermediates | P |
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GO:0000910 | cytokinesis | P |
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GO:0006259 | DNA metabolic process | P |
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GO:0006260 | DNA replication | P |
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GO:0006265 | DNA topological change | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006266 | DNA ligation | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006325 | chromatin organization | P |
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GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
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GO:0006406 | mRNA export from nucleus | P |
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GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
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GO:0007059 | chromosome segregation | P |
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GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
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GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0030263 | apoptotic chromosome condensation | P |
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GO:0031055 | chromatin remodeling at centromere | P |
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GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
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GO:0043065 | positive regulation of apoptosis | P |
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GO:0045070 | positive regulation of viral genome replication | P |
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GO:0045870 | positive regulation of retroviral genome replication | P |
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GO:0048015 | phosphoinositide-mediated signaling | P |
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GO:0051301 | cell division | P |
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GO:0070683 | decatenation checkpoint | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
830 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||
GO:0000228 | nuclear chromosome | C |
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GO:0000793 | condensed chromosome | C |
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GO:0000795 | synaptonemal complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005654 | nucleoplasm | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0005814 | centriole | C |
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GO:0009330 | DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) | C |
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GO:0019035 | viral integration complex | C |
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GO:0043234 | protein complex | C |
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GO:0003677 | DNA binding | F |
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GO:0003682 | chromatin binding | F |
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GO:0003916 | DNA topoisomerase activity | F |
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GO:0003918 | DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity | F |
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GO:0005080 | protein kinase C binding | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0005524 | ATP binding | F |
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GO:0008022 | protein C-terminus binding | F |
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GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0008144 | drug binding | F |
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GO:0019899 | enzyme binding | F |
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GO:0042803 | protein homodimerization activity | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0042826 | histone deacetylase binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0043130 | ubiquitin binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||
GO:0043566 | structure-specific DNA binding | F |
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GO:0046982 | protein heterodimerization activity | F |
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GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
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GO:0000910 | cytokinesis | P |
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GO:0006259 | DNA metabolic process | P |
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GO:0006260 | DNA replication | P |
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GO:0006265 | DNA topological change | P |
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GO:0006266 | DNA ligation | P |
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GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
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GO:0006974 | response to DNA damage stimulus | P |
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GO:0007059 | chromosome segregation | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
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GO:0008152 | metabolic process | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0030261 | chromosome condensation | P |
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GO:0030263 | apoptotic chromosome condensation | P |
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GO:0031055 | chromatin remodeling at centromere | P |
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GO:0040016 | embryonic cleavage | P |
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GO:0043065 | positive regulation of apoptosis | P |
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GO:0045070 | positive regulation of viral genome replication | P |
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GO:0045870 | positive regulation of retroviral genome replication | P |
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GO:0045944 | positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||
GO:0048015 | phosphoinositide-mediated signaling | P |
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GO:0051301 | cell division | P |
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GO:0070683 | decatenation checkpoint | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_532 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0000228 | nuclear chromosome | C |
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GO:0000793 | condensed chromosome | C |
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GO:0000795 | synaptonemal complex | C |
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GO:0005625 | soluble fraction | C |
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GO:0005626 | insoluble fraction | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005694 | chromosome | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0008623 | chromatin accessibility complex | C |
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GO:0009330 | DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0000182 | rDNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0000400 | four-way junction DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
GO:0003682 | chromatin binding | F |
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GO:0003696 | satellite DNA binding | F |
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GO:0003729 | mRNA binding | F |
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GO:0003916 | DNA topoisomerase activity | F |
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GO:0003918 | DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity | F |
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GO:0005524 | ATP binding | F |
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GO:0008094 | DNA-dependent ATPase activity | F |
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GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | F |
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GO:0043566 | structure-specific DNA binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
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GO:0000712 | resolution of meiotic recombination intermediates | P |
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GO:0000819 | sister chromatid segregation | P |
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GO:0000910 | cytokinesis | P |
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GO:0001764 | neuron migration | P |
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GO:0006259 | DNA metabolic process | P |
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GO:0006265 | DNA topological change | P |
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GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
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GO:0006325 | chromatin organization | P |
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GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006406 | mRNA export from nucleus | P |
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GO:0007052 | mitotic spindle organization | P |
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GO:0007059 | chromosome segregation | P |
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GO:0007067 | mitosis | P |
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GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
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GO:0007126 | meiosis | P |
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GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
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GO:0007409 | axonogenesis | P |
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GO:0008152 | metabolic process | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0016246 | RNA interference | P |
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GO:0030261 | chromosome condensation | P |
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GO:0030900 | forebrain development | P |
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GO:0031055 | chromatin remodeling at centromere | P |
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GO:0040016 | embryonic cleavage | P |
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GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
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GO:0045944 | positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0051301 | cell division | P |
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GO:0051310 | metaphase plate congression | P |
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GO:0070683 | decatenation checkpoint | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPBC1A4.03c (P08096) | YNL088W (S000005032) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
GO:0000228 | nuclear chromosome | C |
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GO:0000795 | synaptonemal complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005739 | mitochondrion | C |
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GO:0003918 | DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity | F |
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GO:0005524 | ATP binding | F |
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GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
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GO:0000712 | resolution of meiotic recombination intermediates | P |
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GO:0006265 | DNA topological change | P |
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GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
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GO:0006325 | chromatin organization | P |
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GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
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GO:0006406 | mRNA export from nucleus | P |
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GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
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GO:0007131 | reciprocal meiotic recombination | P |
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GO:0031055 | chromatin remodeling at centromere | P |
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GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
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GO:0070683 | decatenation checkpoint | P |
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