YOGY Home | YOGY Help |
|
KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG3320 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | 40S ribosomal protein S7 |
HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
107038 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Homo sapiens (Hsa) | RPS7 | GI:4506741 | P62081 |
Pan troglodytes (Ptr) | RPS7 | GI:55639547 | |
Canis familiaris (Cfa) | RPS7 | GI:57098089 | |
Mus musculus (Mmu) | Rps7 (MGI:1333818) | GI:6755376 | P62082 |
Rattus norvegicus (Rno) | LOC497813 | GI:66730357 | |
Rattus norvegicus (Rno) | Rps7 (RGD:61907) | GI:109477971 | |
Gallus gallus (Gga) | RPS7 | GI:118088890 | |
Drosophila melanogaster (Dme) | RpS7 (FBgn0039757) | GI:21358459 | |
Anopheles gambiae (Aga) | AgaP_AGAP010592 | GI:158293234 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | rps-7 (CE06577; WBGene00004476) | GI:17508689 | Q23312 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | RPS7B (S000005040) | GI:6324233 | P48164 |
Arabidopsis thaliana (Ath) | AT5G16130 | GI:15237278 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | AT3G02560 | GI:30678607 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | PF13_0014 | GI:124512798 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||
GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0005811 | lipid particle | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0005840 | ribosome | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0022626 | cytosolic ribosome | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0030529 | ribonucleoprotein complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0032040 | small-subunit processome | C |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0003723 | RNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0003735 | structural constituent of ribosome | F |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0006364 | rRNA processing | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0006412 | translation | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0006414 | translational elongation | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0008150 | biological_process | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0009790 | embryo development | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0042254 | ribosome biogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0042274 | ribosomal small subunit biogenesis | P |
|
OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_1039 | ![]() |
Species | OrthoMCL sequence | Model organism protein page | UniProt link |
Anopheles gambiae (Aga) | aga7553 | ENSANGP00000016949 | |
Ashbya gossypii (Ago) | ago973 | ACL076W | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath4154 | At1g48830.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath4155 | At1g48830.2 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath12274 | At3g02560.1 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath12275 | At3g02560.2 | |
Arabidopsis thaliana (Ath) | ath23831 | At5g16130.1 | |
Caenorhabditis elegans (Cel) | cel21345 | ZC434.2 (CE06577; WBGene00004476) | |
Candida glabrata (Cgl) | cgl1905 | CAGL0G06490g | |
Cryptococcus neoformans (Cne) | cne126 | 162.m02671 | |
Dictyostelium discoideum (Ddi) | ddi12869 | DDB0230024 | |
Debaryomyces hansenii (Dha) | dha422 | DEHA0A09515g | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15192 | CG1883-PA (FBgn0039757) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15194 | CG1883-PB (FBgn0039757) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15193 | CG1883-PC (FBgn0039757) | |
Drosophila melanogaster (Dme) | dme15191 | CG1883-PD (FBgn0039757) | |
Danio rerio (Dre) | dre12626 | ENSDARP00000015957 | |
Takifugu rubripes (Fru) | fru29850 | SINFRUP00000131272 | |
Gallus gallus (Gga) | gga15935 | ENSGALP00000026392 (RPS7) | |
Homo sapiens (Hsa) | hsa17414 | ENSP00000339095 (RPS7) | P62081 |
Kluyveromyces lactis (Kla) | kla1802 | KLLA0C13519g | |
Mus musculus (Mmu) | mmu13516 | ENSMUSP00000073653 | |
Mus musculus (Mmu) | mmu5569 | ENSMUSP00000073880 (MGI:1333818) | P62082 |
Neurospora crassa (Ncr) | ncr248 | NCU00258.2 | |
Oryza sativa (Osa) | osa49553 | 5845.m00129 | |
Oryza sativa (Osa) | osa49554 | 5845.m00130 | |
Oryza sativa (Osa) | osa56512 | 6193.m00169 | |
Oryza sativa (Osa) | osa56531 | 6194.m00125 | |
Oryza sativa (Osa) | osa77788 | 7475.m00127 | |
Oryza sativa (Osa) | osa77791 | 7475.m00128 | |
Plasmodium falciparum (Pfa) | pfa4083 | PF13_0014 | |
Rattus norvegicus (Rno) | rno24956 | ENSRNOP00000011333 (RGD:1583750) | P62083 |
Rattus norvegicus (Rno) | rno24482 | ENSRNOP00000011545 (RGD:1583750) | P62083 |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce5209 | YNL096C (S000005040) | |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | sce5832 | YOR096W (S000005622) | |
Schizosaccharomyces pombe (Spo) | spo1285 | SPAC18G6.14c | Q10101 |
Yarrowia lipolytica (Yli) | yli363 | YALI0A10725g |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||
GO:0005618 | cell wall | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005811 | lipid particle | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0005886 | plasma membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009507 | chloroplast | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0022626 | cytosolic ribosome | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030529 | ribonucleoprotein complex | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0030686 | 90S preribosome | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0032040 | small-subunit processome | C |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0003735 | structural constituent of ribosome | F |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0006412 | translation | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0008150 | biological_process | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009790 | embryo development | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||
GO:0042254 | ribosome biogenesis | P |
|
Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPAC18G6.14c (Q10101) | YNL096C (S000005040) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||
GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||
GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||
GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | C |
| ||||||||
GO:0032040 | small-subunit processome | C |
| ||||||||
GO:0003735 | structural constituent of ribosome | F |
| ||||||||
GO:0006412 | translation | P |
| ||||||||
GO:0042254 | ribosome biogenesis | P |
|
YOGY Home | YOGY Help |
s.khadayate@ucl.ac.uk |