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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG3149 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | Transcription initiation factor IIF, auxiliary subunit |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||
GO:0000784 | nuclear chromosome, telomeric region | C |
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GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
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GO:0000812 | Swr1 complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005654 | nucleoplasm | C |
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GO:0005669 | transcription factor TFIID complex | C |
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GO:0005674 | transcription factor TFIIF complex | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0016363 | nuclear matrix | C |
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GO:0016514 | SWI/SNF complex | C |
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GO:0016586 | RSC complex | C |
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GO:0016592 | mediator complex | C |
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GO:0031011 | Ino80 complex | C |
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GO:0033100 | NuA3 histone acetyltransferase complex | C |
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GO:0033255 | SAS acetyltransferase complex | C |
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GO:0035267 | NuA4 histone acetyltransferase complex | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0003682 | chromatin binding | F |
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GO:0003700 | transcription factor activity | F |
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GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
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GO:0004468 | lysine N-acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0008022 | protein C-terminus binding | F |
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GO:0008080 | N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0008415 | acyltransferase activity | F |
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GO:0016251 | general RNA polymerase II transcription factor activity | F |
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GO:0016407 | acetyltransferase activity | F |
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GO:0016410 | N-acyltransferase activity | F |
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GO:0016746 | transferase activity, transferring acyl groups | F |
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GO:0016747 | transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups | F |
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GO:0017025 | TATA-binding protein binding | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
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GO:0006355 | regulation of transcription, DNA-dependent | P |
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GO:0006366 | transcription from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0006367 | transcription initiation from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0007067 | mitosis | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0009890 | negative regulation of biosynthetic process | P |
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GO:0009892 | negative regulation of metabolic process | P |
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GO:0010558 | negative regulation of macromolecule biosynthetic process | P |
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GO:0010605 | negative regulation of macromolecule metabolic process | P |
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GO:0010629 | negative regulation of gene expression | P |
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GO:0016246 | RNA interference | P |
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GO:0016458 | gene silencing | P |
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GO:0016481 | negative regulation of transcription | P |
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GO:0016573 | histone acetylation | P |
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GO:0031324 | negative regulation of cellular metabolic process | P |
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GO:0031327 | negative regulation of cellular biosynthetic process | P |
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GO:0032568 | general transcription from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0034605 | cellular response to heat | P |
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GO:0040029 | regulation of gene expression, epigenetic | P |
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GO:0042766 | nucleosome mobilization | P |
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GO:0043486 | histone exchange | P |
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GO:0043967 | histone H4 acetylation | P |
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GO:0043968 | histone H2A acetylation | P |
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GO:0045814 | negative regulation of gene expression, epigenetic | P |
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GO:0045892 | negative regulation of transcription, DNA-dependent | P |
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GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-dependent | P |
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GO:0045934 | negative regulation of nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic process | P |
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GO:0051123 | RNA polymerase II transcriptional preinitiation complex assembly | P |
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GO:0051172 | negative regulation of nitrogen compound metabolic process | P |
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GO:0051253 | negative regulation of RNA metabolic process | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
4760 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||
GO:0000812 | Swr1 complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005654 | nucleoplasm | C |
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GO:0005669 | transcription factor TFIID complex | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
| ||||||||||||||
GO:0016363 | nuclear matrix | C |
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GO:0035267 | NuA4 histone acetyltransferase complex | C |
| ||||||||||||||
GO:0003674 | molecular_function | F |
| ||||||||||||||
GO:0003677 | DNA binding | F |
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GO:0003682 | chromatin binding | F |
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GO:0003700 | transcription factor activity | F |
| ||||||||||||||
GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||
GO:0004468 | lysine N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||
GO:0008022 | protein C-terminus binding | F |
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GO:0008080 | N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0008415 | acyltransferase activity | F |
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GO:0016251 | general RNA polymerase II transcription factor activity | F |
| ||||||||||||||
GO:0016407 | acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||
GO:0016410 | N-acyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||
GO:0016746 | transferase activity, transferring acyl groups | F |
| ||||||||||||||
GO:0016747 | transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
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GO:0006367 | transcription initiation from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0007067 | mitosis | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0016246 | RNA interference | P |
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GO:0016573 | histone acetylation | P |
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GO:0043486 | histone exchange | P |
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GO:0043967 | histone H4 acetylation | P |
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GO:0043968 | histone H2A acetylation | P |
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GO:0045893 | positive regulation of transcription, DNA-dependent | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_2435 | ![]() |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||
GO:0000812 | Swr1 complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005654 | nucleoplasm | C |
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GO:0005669 | transcription factor TFIID complex | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0035267 | NuA4 histone acetyltransferase complex | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0003682 | chromatin binding | F |
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GO:0003700 | transcription factor activity | F |
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GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||||||
GO:0004468 | lysine N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0005515 | protein binding | F |
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GO:0008080 | N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0008415 | acyltransferase activity | F |
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GO:0016251 | general RNA polymerase II transcription factor activity | F |
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GO:0016407 | acetyltransferase activity | F |
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GO:0016410 | N-acyltransferase activity | F |
| ||||||||||||||||||
GO:0016746 | transferase activity, transferring acyl groups | F |
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GO:0016747 | transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups | F |
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GO:0000003 | reproduction | P |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
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GO:0006355 | regulation of transcription, DNA-dependent | P |
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GO:0006367 | transcription initiation from RNA polymerase II promoter | P |
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GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
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GO:0016246 | RNA interference | P |
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GO:0016573 | histone acetylation | P |
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GO:0043486 | histone exchange | P |
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Curated yeast ortholog results:
S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
SPAC17G8.07 (Q10319) | YNL107W (S000005051) |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
GO:0000812 | Swr1 complex | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005737 | cytoplasm | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0035267 | NuA4 histone acetyltransferase complex | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0004402 | histone acetyltransferase activity | F |
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GO:0004468 | lysine N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0008080 | N-acetyltransferase activity | F |
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GO:0008415 | acyltransferase activity | F |
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GO:0016407 | acetyltransferase activity | F |
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GO:0016410 | N-acyltransferase activity | F |
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GO:0016746 | transferase activity, transferring acyl groups | F |
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GO:0016747 | transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups | F |
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GO:0006281 | DNA repair | P |
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GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
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GO:0006342 | chromatin silencing | P |
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GO:0006348 | chromatin silencing at telomere | P |
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GO:0016573 | histone acetylation | P |
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GO:0043486 | histone exchange | P |
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