| YOGY Home | YOGY Help |
|
| KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
| KOG0981 | ACDHYP-![]() |
| KOGs classification | KOGs description |
| INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | DNA topoisomerase I |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||
| GO:0000228 | nuclear chromosome | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0005654 | nucleoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0005739 | mitochondrion | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0031298 | replication fork protection complex | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0031616 | spindle pole centrosome | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0042645 | mitochondrial nucleoid | C |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0003682 | chromatin binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0003917 | DNA topoisomerase type I activity | F |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0000183 | chromatin silencing at rDNA | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0002009 | morphogenesis of an epithelium | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006259 | DNA metabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006265 | DNA topological change | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006325 | chromatin organization | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006357 | regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006368 | RNA elongation from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0007097 | nuclear migration | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0008406 | gonad development | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0009790 | embryo development | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0009791 | post-embryonic development | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0009933 | meristem structural organization | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0009965 | leaf morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0010016 | shoot morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0010075 | regulation of meristem growth | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0010171 | body morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0012501 | programmed cell death | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0016310 | phosphorylation | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0018996 | molting cycle, collagen and cuticulin-based cuticle | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0019827 | stem cell maintenance | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0040010 | positive regulation of growth rate | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0042493 | response to drug | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0045132 | meiotic chromosome segregation | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0048439 | flower morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0048477 | oogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||
| GO:0048645 | organ formation | P |
|
| HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
| 2467 | ![]() |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000228 | nuclear chromosome | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005654 | nucleoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005665 | DNA-directed RNA polymerase II, core complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005703 | polytene chromosome puff | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005719 | nuclear euchromatin | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005875 | microtubule associated complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031298 | replication fork protection complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031616 | spindle pole centrosome | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0043204 | perikaryon | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003682 | chromatin binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003916 | DNA topoisomerase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003917 | DNA topoisomerase type I activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031490 | chromatin DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0032403 | protein complex binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000183 | chromatin silencing at rDNA | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002009 | morphogenesis of an epithelium | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002168 | instar larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006259 | DNA metabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006260 | DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006265 | DNA topological change | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006325 | chromatin organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006357 | regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006368 | RNA elongation from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007059 | chromosome segregation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007097 | nuclear migration | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007275 | multicellular organismal development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008283 | cell proliferation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008406 | gonad development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009303 | rRNA transcription | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009790 | embryo development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009791 | post-embryonic development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009933 | meristem structural organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009965 | leaf morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0010016 | shoot morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0010075 | regulation of meristem growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0010171 | body morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0012501 | programmed cell death | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016310 | phosphorylation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0018996 | molting cycle, collagen and cuticulin-based cuticle | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0019827 | stem cell maintenance | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0030261 | chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040010 | positive regulation of growth rate | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040016 | embryonic cleavage | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0042493 | response to drug | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0045132 | meiotic chromosome segregation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048439 | flower morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048477 | oogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048645 | organ formation | P |
|
| OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
| OG1_838 | ![]() |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005665 | DNA-directed RNA polymerase II, core complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005703 | polytene chromosome puff | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005719 | nuclear euchromatin | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005737 | cytoplasm | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005875 | microtubule associated complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0016020 | membrane | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031298 | replication fork protection complex | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031616 | spindle pole centrosome | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0043204 | perikaryon | C |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003677 | DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003916 | DNA topoisomerase activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0003917 | DNA topoisomerase type I activity | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0005515 | protein binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0031490 | chromatin DNA binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0032403 | protein complex binding | F |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000003 | reproduction | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0000183 | chromatin silencing at rDNA | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002009 | morphogenesis of an epithelium | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002119 | nematode larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0002168 | instar larval development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006259 | DNA metabolic process | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006260 | DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006265 | DNA topological change | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006325 | chromatin organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006338 | chromatin remodeling | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006357 | regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006368 | RNA elongation from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0006898 | receptor-mediated endocytosis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007059 | chromosome segregation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007097 | nuclear migration | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0007275 | multicellular organismal development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008283 | cell proliferation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008340 | determination of adult lifespan | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0008406 | gonad development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009303 | rRNA transcription | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009790 | embryo development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009791 | post-embryonic development | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009792 | embryo development ending in birth or egg hatching | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009933 | meristem structural organization | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0009965 | leaf morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0010016 | shoot morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0010075 | regulation of meristem growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0010171 | body morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0018996 | molting cycle, collagen and cuticulin-based cuticle | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0019827 | stem cell maintenance | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0030261 | chromosome condensation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040007 | growth | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040010 | positive regulation of growth rate | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040011 | locomotion | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0040016 | embryonic cleavage | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0045132 | meiotic chromosome segregation | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048439 | flower morphogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048477 | oogenesis | P |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GO:0048645 | organ formation | P |
|
Curated yeast ortholog results:
| S. pombe systematic ID | S. cerevisiae systematic ID |
| SPBC1703.14c (P07799) | YOL006C (S000005366) |
| GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||
| GO:0000790 | nuclear chromatin | C |
| ||||||||||||
| GO:0005634 | nucleus | C |
| ||||||||||||
| GO:0005730 | nucleolus | C |
| ||||||||||||
| GO:0031298 | replication fork protection complex | C |
| ||||||||||||
| GO:0003917 | DNA topoisomerase type I activity | F |
| ||||||||||||
| GO:0000019 | regulation of mitotic recombination | P |
| ||||||||||||
| GO:0000183 | chromatin silencing at rDNA | P |
| ||||||||||||
| GO:0006265 | DNA topological change | P |
| ||||||||||||
| GO:0006271 | DNA strand elongation involved in DNA replication | P |
| ||||||||||||
| GO:0006325 | chromatin organization | P |
| ||||||||||||
| GO:0006333 | chromatin assembly or disassembly | P |
| ||||||||||||
| GO:0006357 | regulation of transcription from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||
| GO:0006368 | RNA elongation from RNA polymerase II promoter | P |
| ||||||||||||
| GO:0007076 | mitotic chromosome condensation | P |
| ||||||||||||
| GO:0007097 | nuclear migration | P |
| ||||||||||||
| GO:0042790 | transcription of nuclear rRNA large RNA polymerase I transcript | P |
|
| YOGY Home | YOGY Help |
| s.khadayate@ucl.ac.uk |