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KOG name | Phylogenetic pattern (and link to KOGs with this pattern) |
KOG1906 | ACDHYPE![]() |
KOGs classification | KOGs description |
INFORMATION STORAGE AND PROCESSING | DNA polymerase sigma |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||||||
GO:0005575 | cellular_component | C |
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GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005681 | spliceosomal complex | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
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GO:0005829 | cytosol | C |
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GO:0031379 | RNA-directed RNA polymerase complex | C |
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GO:0031380 | nuclear RNA-directed RNA polymerase complex | C |
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GO:0031499 | TRAMP complex | C |
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GO:0043234 | protein complex | C |
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GO:0003674 | molecular_function | F |
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GO:0003676 | nucleic acid binding | F |
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GO:0004652 | polynucleotide adenylyltransferase activity | F |
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GO:0016779 | nucleotidyltransferase activity | F |
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GO:0051575 | 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity | F |
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GO:0000077 | DNA damage checkpoint | P |
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GO:0006284 | base-excision repair | P |
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GO:0006364 | rRNA processing | P |
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GO:0007000 | nucleolus organization | P |
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GO:0007059 | chromosome segregation | P |
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GO:0007094 | mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint | P |
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GO:0008150 | biological_process | P |
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GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | P |
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GO:0016073 | snRNA metabolic process | P |
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GO:0016075 | rRNA catabolic process | P |
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GO:0016077 | snoRNA catabolic process | P |
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GO:0016078 | tRNA catabolic process | P |
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GO:0030702 | chromatin silencing at centromere | P |
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GO:0031048 | chromatin silencing by small RNA | P |
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GO:0031125 | rRNA 3'-end processing | P |
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GO:0031134 | sister chromatid biorientation | P |
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GO:0034475 | U4 snRNA 3'-end processing | P |
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GO:0040020 | regulation of meiosis | P |
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GO:0043629 | ncRNA polyadenylation | P |
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GO:0043630 | ncRNA polyadenylation involved in polyadenylation-dependent ncRNA catabolic process | P |
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GO:0043631 | RNA polyadenylation | P |
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GO:0045144 | meiotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0051315 | attachment of spindle microtubules to kinetochore involved in mitotic sister chromatid segregation | P |
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GO:0071031 | nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing | P |
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GO:0071035 | nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process | P |
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GO:0071036 | nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process | P |
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GO:0071037 | nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process | P |
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GO:0071038 | nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process | P |
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GO:0071039 | nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process | P |
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GO:0071040 | nuclear polyadenylation-dependent antisense transcript catabolic process | P |
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GO:0071042 | nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process | P |
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GO:0071044 | histone mRNA catabolic process | P |
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GO:0071047 | polyadenylation-dependent mRNA catabolic process | P |
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GO:0071050 | snoRNA polyadenylation | P |
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GO:0071051 | polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing | P |
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HomoloGene cluster | Phylogenetic pattern |
26203 | ![]() |
Species | Gene ID | NCBI link | UniProt link |
Saccharomyces cerevisiae (Sce) | PAP2 (S000005475) | GI:6324457 | P53632 |
Magnaporthe grisea (Mgr) | MGG_00073 | GI:39975561 | |
Neurospora crassa (Ncr) | NCU05588.1 | GI:32409925 |
GO ID | GO term | GO aspect | Evidence codes and associations | ||||||||||||||||
GO:0005634 | nucleus | C |
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GO:0005730 | nucleolus | C |
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GO:0031499 | TRAMP complex | C |
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GO:0004652 | polynucleotide adenylyltransferase activity | F |
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GO:0051575 | 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity | F |
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GO:0006284 | base-excision repair | P |
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GO:0016073 | snRNA metabolic process | P |
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GO:0034475 | U4 snRNA 3'-end processing | P |
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GO:0043629 | ncRNA polyadenylation | P |
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GO:0071031 | nuclear mRNA surveillance of mRNA 3'-end processing | P |
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GO:0071035 | nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process | P |
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GO:0071036 | nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process | P |
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GO:0071037 | nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process | P |
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GO:0071038 | nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process | P |
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GO:0071039 | nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process | P |
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GO:0071040 | nuclear polyadenylation-dependent antisense transcript catabolic process | P |
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GO:0071042 | nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process | P |
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GO:0071044 | histone mRNA catabolic process | P |
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GO:0071047 | polyadenylation-dependent mRNA catabolic process | P |
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GO:0071050 | snoRNA polyadenylation | P |
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GO:0071051 | polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing | P |
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OrthoMCL cluster | Phylogenetic pattern |
OG1_1104 | ![]() |